| No. | 対局日 | 棋戦名 | 対局相手 | 結果 | 手数 | 戦型 | 備考 |
| 657 | 1999 4/2 | 第70期棋聖戦決勝トーナメント | 谷川浩司九段 | ● | 88 | 横歩取り | |
| 658 | 4/8-9 | 第57期名人戦七番勝負第1局 | 谷川浩司九段 | ○ | 66 | 横歩取り | 名人位初の防衛戦 |
| 4/12 | 第40期王位戦挑戦者決定リーグ紅組 | 阿部 隆七段 | 81 | 角交換その他 | 千日手 | ||
| 659 | 4/12 | 第40期王位戦挑戦者決定リーグ紅組 | 阿部 隆七段 | ○ | 119 | 相掛かり | |
| 660 | 4/21-22 | 第57期名人戦七番勝負第2局 | 谷川浩司九段 | ○ | 81 | 横歩取り | |
| 661 | 4/27 | 第12期竜王戦ランキング戦1組 | 高橋道雄九段 | ○ | 87 | 横歩取り | |
| 662 | 5/6-7 | 第57期名人戦七番勝負第3局 | 谷川浩司九段 | ● | 99 | 角交換腰掛銀 | |
| 5/11 | 第40期王位戦挑戦者決定リーグ紅組 | 杉本昌隆五段 | 110 | 四間飛車 | 千日手 | ||
| 663 | 5/11 | 第40期王位戦挑戦者決定リーグ紅組 | 杉本昌隆五段 | ● | 142 | 四間飛車 | |
| 664 | 5/14 | 第47期王座戦本戦 | 行方尚史五段 | ○ | 104 | 横歩取り | |
| 665 | 5/19-20 | 第57期名人戦七番勝負第4局 | 谷川浩司九段 | ● | 100 | 四間飛車 | |
| 666 | 5/27-28 | 第57期名人戦七番勝負第5局 | 谷川浩司九段 | ● | 89 | 角交換腰掛銀 | |
| 667 | 6/1 | 第40期王位戦挑戦者決定リーグ紅組 | 谷川浩司九段 | ● | 102 | 横歩取り | |
| 668 | 6/7-8 | 第57期名人戦七番勝負第6局 | 谷川浩司九段 | ○ | 203 | 四間飛車 | 203手の激闘を制し3勝3敗に |
| 669 | 6/11 | 第47期王座戦本戦 | 田中寅彦九段 | ○ | 165 | その他の戦型 | |
| 670 | 6/16-17 | 第57期名人戦七番勝負第7局 | 谷川浩司九段 | ○ | 103 | 横歩取り | 4勝3敗で初防衛に成功！ |
| 671 | 6/24 | 第12期竜王戦ランキング戦1組決勝 | 森内俊之八段 | ● | 153 | 角交換腰掛銀 | |
| 7/8 | 第47期王座戦本戦 | 丸山忠久八段 | 63 | 角交換腰掛銀 | 千日手 | ||
| 672 | 7/8 | 第47期王座戦本戦 | 丸山忠久八段 | ● | 150 | 横歩取り | |
| 673 | 7/16 | 第19回オールスター勝抜戦 | 飯塚祐紀五段 | ○ | 106 | 矢倉 | |
| 674 | 7/24 | 第19回オールスター勝抜戦 | 畠山 鎮六段 | ○ | 148 | 横歩取り | |
| 675 | 7/28 | 第12期竜王戦決勝トーナメント | 井上慶太八段 | ● | 138 | 横歩取り | |
| 676 | 8/1 | 第19回オールスター勝抜戦 | 藤井 猛竜王 | ○ | 100 | 四間飛車 | |
| 677 | 8/6 | 第19回オールスター勝抜戦 | 米長邦雄永世棋聖 | ○ | 93 | 相振飛車 | |
| 678 | 8/7 | 第33回早指し選手権戦本戦 | 森 ケイ二九段 | ● | 108 | 横歩取り | |
| 679 | 8/19 | 第25期棋王戦本戦 | 丸山忠久八段 | ○ | 101 | 横歩取り | |
| 680 | 9/1 | 第19回オールスター勝抜戦 | 中田宏樹七段 | ○ | 106 | 横歩取り | 5人勝抜き達成(結局7人抜き)、棋戦優勝回数通算3回目 |
| 681 | 9/6 | 第19回オールスター勝抜戦 | 日浦市郎六段 | ○ | 84 | 四間飛車 | |
| 682 | 9/10 | 第19回オールスター勝抜戦 | 田村康介四段 | ○ | 106 | 角交換腰掛銀 | |
| 683 | 9/15 | 第20回日本シリーズ | 丸山忠久八段 | ● | 119 | 横歩取り | 準優勝 |
| 684 | 9/21 | 第18回全日本プロトーナメント | 北浜健介六段 | ○ | 67 | 横歩取り | |
| 685 | 9/24 | 第19回オールスター勝抜戦 | 谷川浩司棋聖 | ● | 144 | 矢倉 | |
| 686 | 9/27 | 第49回NHK敗争奪戦本戦 | 行方尚史六段 | ● | 114 | 矢倉 | |
| 687 | 10/1 | 第49期王将戦挑戦者決定リーグ戦 | 久保利明六段 | ○ | 144 | 四間飛車 | |
| 688 | 10/15 | 第25期棋王戦本戦 | 郷田真隆八段 | ○ | 153 | 相掛かり | |
| 689 | 10/22 | 第49期王将戦挑戦者決定リーグ戦 | 丸山忠久八段 | ○ | 147 | 横歩取り | |
| 690 | 10/26 | 第41期王位戦予選 | 金沢孝史四段 | ○ | 76 | 相掛かり | |
| 691 | 11/2 | 第49期王将戦挑戦者決定リーグ戦 | 中原 誠永世十段 | ● | 126 | 四間飛車 | |
| 692 | 11/4 | 第18回全日本プロトーナメント | 淡路仁茂九段 | ○ | 83 | 相掛かり | |
| 693 | 11/9 | 第49期王将戦挑戦者決定リーグ戦 | 郷田真隆八段 | ○ | 172 | 矢倉 | |
| 11/12 | 第41期王位戦予選 | 堀口一史座五段 | 55 | 角交換腰掛銀 | 千日手 | ||
| 694 | 11/12 | 第41期王位戦予選 | 堀口一史座五段 | ○ | 91 | 矢倉 | |
| 695 | 11/25 | 第25期棋王戦本戦 | 島 朗八段 | ● | 114 | 矢倉 | |
| 696 | 11/29 | 第30回新人王戦記念対局 | 藤井 猛竜王 | ○ | 163 | 四間飛車 | |
| 697 | 12/3 | 第71期棋聖戦棋聖リーグ | 松本佳介四段 | ● | 131 | 相掛かり | |
| 698 | 12/7 | 第41期王位戦予選 | 中田宏樹七段 | ● | 142 | 相掛かり | |
| 699 | 12/10 | 第49期王将戦挑戦者決定リーグ戦 | 森下 卓八段 | ○ | 122 | 横歩取り | |
| 700 | 12/13 | 第49期王将戦挑戦者決定リーグ戦 | 谷川浩司棋聖 | ○ | 95 | 矢倉 | |
| 701 | 12/17 | 第25期棋王戦本戦 | 藤井 猛竜王 | ○ | 119 | 四間飛車 | |
| 702 | 12/20 | 第18回全日本プロトーナメント | 伊奈裕介四段 | ● | 180 | 相掛かり | |
| 703 | 12/24 | 第25期棋王戦本戦(敗者復活戦) | 島 朗八段 | ● | 115 | 矢倉 | |
| 704 | 12/27 | 第71期棋聖戦棋聖リーグ | 羽生善治四冠 | ● | 79 | 四間飛車 | |
| 705 | 2000 1/8-9 | 第49期王将戦七番勝負第1局 | 羽生善治王将 | ● | 114 | 横歩取り | |
| 706 | 1/17-18 | 第49期王将戦七番勝負第2局 | 羽生善治王将 | ● | 105 | 相掛かり | |
| 707 | 1/24 | 第71期棋聖戦棋聖リーグ | 丸山忠久八段 | ○ | 145 | 横歩取り | |
| 708 | 1/26-27 | 第49期王将戦七番勝負第3局 | 羽生善治王将 | ● | 102 | 四間飛車 | |
| 79 | 1/31 | 第13期竜王戦ランキング戦1組 | 中川大輔六段 | ○ | 105 | 四間飛車 | |
| 710 | 2/7-8 | 第49期王将戦七番勝負第4局 | 羽生善治王将 | ● | 121 | 角交換腰掛銀 | 0勝4敗で敗退、奪取できず |
| 711 | 2/21 | 第13期竜王戦ランキング戦1組 | 丸山忠久八段 | ○ | 73 | 横歩取り | |
| 712 | 3/17 | 第71期棋聖戦決勝トーナメント | 行方尚史六段 | ○ | 164 | 矢倉 |